Radiotaajuustunnistusjärjestelmän perustyötila on jaettu kaksisuuntaiseen (kaksisuuntainen) ja kaksisuuntaiseen (half duplex) -järjestelmään ja sekvenssijärjestelmään (SEQ). Kaksisuuntaisuus tarkoittaa, että radiotaajuustunniste ja lukija voivat välittää tietoja toisilleen samanaikaisesti. Kaksisuuntaisuus tarkoittaa, että radiotaajuustunniste ja lukija voivat välittää tietoa molempiin suuntiin, mutta voivat lähettää tietoja vain yhteen suuntaan samanaikaisesti.
Kaksisuuntaisessa ja kaksisuuntaisessa järjestelmissä radiotaajuustunnisteen vaste lähetetään sähkömagneettisen kentän tai lukijan lähettämän sähkömagneettisen aallon alla. Koska verrattuna itse lukijan signaaliin, radiotaajuustunnisteen signaali on hyvin heikko vastaanottavassa antennissa, joten on käytettävä sopivaa lähetystapaa radiotaajuustunnisteen signaalin erottamiseksi lukijan signaalista.